Situé en Afrique équatoriale, au cœur du bassin du Congo, Afrotopia suit Ezéchiel, un cinéaste en herbe de 25 ans qui vit sous l’autorité de son père, Maurice, un puissant homme d’affaires qui s’oppose à ses ambitions artistiques. Face aux difficultés financières, Ezekiel est obligé de rejoindre l’entreprise forestière familiale. Envoyé en mission, il découvre que Maurice envisage d’exploiter une forêt sacrée, dernier refuge d’une communauté autochtone.